中棉所、国家棉花产业技术体系项目组，于2013年6月中旬定点监测湘、鄂、皖、赣、苏、豫、冀、鲁、晋、陕、新、甘、辽等16省130个县（团、场）4100户的棉花长势情况，结合对西北、长江和黄河的考察，发布长势监测报告。
苗情长势差于去年同期，普遍存在迟发问题。
中国棉花生长指数（CCGI）6月为93（表1），真叶数9.1片/株，表明苗情差于去年同期的半成多，为常年的99，略差于常年。主要特点：一是一类苗早发棉田、果枝5～6个/株棉田面积比例少于去年，三类棉田比例偏大。二是营养生长偏旺，生殖生长偏弱，普遍存在迟发问题。
从5月中旬到6月中旬的天气来看，气候极为异常。一是长江旱涝、低温与高温天气相间；6月中旬气温偏高，≥35℃极端高温持续几日，苗情长势偏弱。二是黄河多雨，日照时数减少，气温忽高忽低；降水偏多，却对河北半干旱棉区与滨海盐碱地棉花有利。三是南疆棉区遭遇冰雹、强降雨、洪涝和低温侵袭，频率高，灾情重，面积大；北疆棉区遭遇气温持续偏低，降水持续偏多，日照持续偏少，生育持续偏弱，整体长势为营养生长偏旺，现蕾少，迟发严重。四是局部棉田棉蓟马、盲蝽橡、棉蚜与“两萎病”发生偏重，防治效果较好。
长江CCGI6月为85，为常年的90，真叶数7.9片/株。苗情差于去年同期一成半，差于常年一成。油后和麦后移栽正常略早，但移栽前后干旱与多雨相间，不利于返苗发棵生长，迟发5～7天；连作棉田“两萎病"发生面积大，因多雨局部棉田棉盲蝽蟓为害严重。
黄河CCGI6月为96，为常年的104，真叶数10.2片/株。苗情少于去年同期0.5片/株。整体看，因降水日多，雨量分布均匀，却对河北半干旱与滨海盐碱地棉花生长较为有利；虽然长势偏旺，但现蕾多，早发。因雨日多，气温低，寡照，黄淮平原两熟棉田长势偏弱；加上今年大蒜价格一落千丈，农户雇工减少，收蒜时间延后，蒜田腾地晚，棉蒜共生期延长，管理滞后导致迟发。但6月上中旬雨日多有利麦茬移栽棉的返苗发棵生长。
西北CCGI6月为95，为常年的98。真叶数8.7片/株，少于去年同期0.5片/株。其中南疆9.0片/株，少于去年同期0.2片/株；北疆8.4片/株，少于去年同期0.7片/株；河西走廊9.2片/株，少于去年同期0.3片/株。本流域存在生殖滞后与迟发问题，特别是北疆，去年6月中旬见花，6月下旬进入盛花期，今年现蕾少，迟发10天。同时，南疆冰雹和洪涝灾害发生频率高，范围广，棉田受灾和绝收面积大幅增加。
辽河CCGI6月为80，为常年的137，真叶数7.2片/株。因低温多雨寡照，苗情差于去年同期将近二成，好与常年四成。